植物???内的激素广泛地在各组织和器官内移动，这是调节特定组织或器官内活性激素水平的手段。
生长素在高等植物中分布很广，根、茎、叶、花、果实、种子及胚芽鞘中都有。它的含量甚微，每克鲜重植物材料，一般含10—100ng生长素。生长素大多集中于生长旺盛部分（如胚芽鞘、芽和根尖的分生组织、形成层、受精后的子房、幼嫩种子等）。
游离的生长素在植物体内的运输的主要方式是极性运输。极性运输的特点是：运输方向是由形态学的顶端到极端（根中是从根的基部向根尖—向顶运输）。这种极性运输只局限于胚芽鞘、幼茎及幼根的薄壁细胞之间，运输距离短，运输速度仅约5—20mm.h – 1。IAA是唯一具有极性运输特点的植物激素，这种极性运输产生的IAA的梯度分布。IAA的极性运动是由某些载体介导的主动运输。呼吸链抑制剂氰化物和解偶联剂DNP（氧化磷酸化解偶联）能抑制IAA的极性运输，说明IAA的极性运输需要有氧呼吸提供能量。
除了极性运输方式外，IAA还有非极性的远距离运输方式。如萌发的玉米幼苗中，主要运输形式为IAA—肌醇，IAA—肌醇则来自一些IAA酯的水解，并通过微管组织移动到生长中的幼苗中，进而由酶促水解释放出游离态IAA。
