C
解:满足条件x2+y2≤1的点(x,y)构成的平面区域为一个圆,其面积为π;
∵当0≤x<1,0≤y<1时,满足条件[x]2+[y]2≤1;当0≤x<1,1≤y<2时,满足条件[x]2+[y]2≤1;
当0≤x<1,-1≤y<0时,满足条件[x]2+[y]2≤1;当-1≤x<0,0≤y<1时,满足条件[x]2+[y]2≤1;
当1≤x<2,0≤y<1时,满足条件[x]2+[y]2≤1
∴满足条件[x]2+[y]2≤1的点(x,y)构成的平面区域是5个边长为1的正方形,其面积为5.
综上得:S1与S2的关系是S1<S2,
故选C.